阜康历史悠久、底蕴深厚。汉宣帝神爵二年(公元前60年)划入汉朝版图，为西汉属国车师后部和卑陆国，时有227户1387人。唐朝属庭州金满县，元为回鹘五城之地，明朝时属瓦剌汗国，清初为准噶尔汗国土尔扈特部游牧地。乾隆二十八年(1763年)建特纳格尔城(蒙古语:水草丰茂的地方)，陕甘总督杨应琚将驻乌鲁木齐的携眷兵522户1796人移驻。